Ce marais est l'une des principales zones humides du département. Abritant une diversité remarquable d'espèces adaptées aux inondations régulières, il contribue au maintien de la qualité des eaux par son pouvoir épurateur.
La présence du marais de Lapoumignague s'explique par trois raisons : la morphologie de la vallée de la Masse (fond plat) ; la nature de son substrat, formé d'argiles anciennes imperméables et recouvertes d'alluvions récentes ; et l'apport local de plusieurs sources. Le niveau d'eau y varie au cours de l'année : Entre octobre et avril, le marais est en grande partie inondé tandis qu'en été, l’eau descend en dessous de la surface.